目前对蝌蚪期疾病了解较少，常见的有气泡病，也叫大肚子病，还有弯尾病、水霉病和寄生虫病等。目前没有太好的办法治疗，主要是预防，最好的办法就是消毒，种蛙和卵团要消毒，繁殖场在使用前彻底消毒，饲养过程中要经常对水池消毒。通常用lppm漂白粉溶液。
（1）气泡病患病
蝌蚪腹部膨大、朝上仰卧漂浮水面，逐渐因腹部膨胀而死。病因主要是水中溶氧不足，蝌蚪浮到水面大量吞食空气所致。防治办法：疏散蝌蚪，减小密度；向池中注入新鲜水，提高水中溶氧量。已发病较轻的蝌蚪会逐渐恢复。
（2）水霉病
患病蝌蚪常在池边缓慢游动，食欲减退和拒食而死亡。病因是蝌蚪胺伤导臻水霉菌侵入所致，病蛙患处有水霉状白毛。防治办法：预先用石灰清池消毒，尽量减少碰伤蝌蚪皮肤，患病蝌蚪用5ppm高锰酸钾液浸浴30分钟，每天一次，几天后便可痊愈。
（3）寄生虫病
一种是车轮虫病，早期蝌蚪被车轮虫寄生在皮肤表面和鳃部，病蛙鳃部出现青灰色斑点，尾部发白，游泳迟缓，生长停滞而死亡。防治办法：清池消毒，控制放养密度，保持池水清洁；用硫酸铜和硫酸亚铁合剂（5：2）全池喷洒有较好疗效。另外还有舌杯虫病和纤毛虫病，都是因为放养密度太大，水质污染，寄生虫大量发生所致。防治办法：及早更换池水，疏散蝌蚪；用硫酸铜lppm浓度全池喷洒有效果。
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