蛤蚧是变温动物，体温随环境温度的变化而变化。环境温度适宜，蛤蚧食欲旺盛、食量增加，生长速度加快；温度降低时蛤蚧体温降低，活动量减小，食欲减退，食量小或不食，生长速度降低或不长。一年四季的温度变化能给蛤蚧带来一系列的生理变化。
当温度达到１２℃以上时，蛤蚧能出来活动；当温度降低到１２℃以下时，蛤蚧新陈代谢水平大大降低，停止活动和取食，进入冬眠状态；当温度升到１３～１４℃时，蛤蚧从冬眠状态醒来开始活动，但还不取食；当环境温度升到１８℃时，活动频繁并开始取食。在人工饲养条件下，有人将室内温度保持在２０℃，企图打破其冬眠状态，蛤蚧能出来活动，但取食量很小，活动期不长，这样倒不如让其冬眠，因为活动要消耗体内物质，对第二年的繁殖不利。蛤蚧在高温环境下，体温升高，因失水容易造成死亡。
当环境温度２６～３０℃时，蛤蚧反应正常，呼吸频率３０～５５次／分，当环境温度达到４０℃时，１５分后便表现烦躁不安，张口吐舌；当环境温度升高到４５℃时，呼吸频率加快到１２０次／分，开始乱窜，指（趾）翻卷，失去爬行能力和吸附力，肢体僵硬，尾不能动，向上高高翘起；４５℃的温度持续２５分，能使蛤蚧停止呼吸。蛤蚧喜温暖怕寒冷，自然条件下分布在北亚热带无霜雪的地方，冬季气温在０℃以下的地方极少有分布。在人工饲养条件下，越冬室内温度在１０℃左右，这样可安全越冬。经过观察发现肥而健壮的个体能忍受５℃左右的温度，瘦弱的个体能忍受８℃左右的温度，幼小的蛤蚧在１３℃的温度下就被冻死。
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