养殖过程中，出现肠道疾病的几率较高，而处理不当容易引起甲鱼肠道损伤并减缓恢复速度，增大甲鱼摄食恢复周期。认清肠道疾病的异同，区别对待，保证甲鱼摄食的顺畅，达到甲鱼养殖效果最佳状态。
一、引起肠炎的原因多为饲料变质特别是饲料原料中鱼粉的变质，或饲料中有刺激性物质损伤肠道引发感染所致，特别是有些地区长期投喂冰鲜海鱼，就极易发生这种疾病。而暴发则因发病初期没有及时控制或隔离病鳖，特别是饲料在水下投喂的养鳖场，因饲料质量不好时，会有大量变质的剩饵分解于水中使水质很快恶化，就极易引起疾病暴发。此病主要是因过度摄食引起的。原因一：是高温季节进苗，当稚鳖体质恢复，食量 明显增加；原因二：是天气反差大。气温不稳定，致使甲鱼食量不均衡；原因三：是没有及时分池，个体大小差异大，往往造成较大个体的甲鱼过度摄食。其次，池塘水质恶化、饲料变质等也台引发此病，特别是有些地区长期投喂冰鲜海鱼，就极易发生这种疾病。二、肠炎种类病鳖外观正常，无斑点，无溃疡。解剖前见病鳖伏于水面平板上，精神不振 ，对外部刺激反应迟钝，不食。内部解剖见肠系膜弥散性充血，胃肠内无食，肠道内有暗红色液体流出。肝脏色泽较正常鳖淡，偶有白色斑点。脾色深，肿大。肾驻肿大，有充血感。偶有腹内伴有少量腹水。肠炎可以分为细菌性肠炎、应激性肠炎与食物性肠炎，每种肠炎的区别如下：细菌性肠炎的典型症状是甲鱼肛门处红肿，粪便具气泡且浮于水面；应激性肠炎，甲鱼粪便不成形伴随鼻涕状粘液（肠道粘膜）；食物性肠炎，甲鱼粪便中具未消化完全的食物。三、防治方法细菌性肠炎，前期使用抗生素（氟哌酸、庆大霉素、诺氟沙星等高敏药物）和盐酸小檗碱杀灭或抑制肠道致病菌，为重新构建甲鱼肠道微生态系统，后续一个疗程应当适当添加产酶益生素、电解多维与食母生等物质。应激性肠炎，首先排除应激来源，降低应激引起后续影响，投饵中适当添加电解多维、葡萄糖、产酶益生素和盐酸小檗碱。食物性肠炎，应先排除不新鲜饵料，降低投喂量，并适当添加电解多维、葡萄糖、产酶益生素、大蒜素和盐酸小檗碱。发生肠炎时，甲鱼摄食量降低，水体残饵量变大，且水体微生态菌群伴随甲鱼肠道菌群恶化而易改变。多数细菌性肠炎致病菌为条件致病菌，如大肠杆菌、嗜水气单胞菌等，定期消毒可减少甲鱼肠道疾病的发生。甲鱼适于在安静的环境中养殖，日常管理尽量减少尖锐刺耳的声响，按照三定原则投喂，注意监控甲鱼投喂量与摄食情况，有助于甲鱼肠道疾病的预防。
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