蝇蛆的利用有两种方法。第一种利用方法为活体直接利用：把蛆收集起来后直接投喂经济动物。由于本养殖技术采用了EM有效微生物，养殖出来的蛆已基本不带有害病菌，所以不必经过消毒就可直接投喂。家禽类动物只能投喂饲料总量的5--10％，另补充一些一般的饲料就可满足家禽的营养需要。如果蝇蛆对家禽的投喂量超过10％，由于蝇蛆含蛋白太高，就会引起家禽消化不良而拉稀；水产动物类可投喂100％的鲜蝇蛆；畜牧、特种类动物一般采用蛆粉加入饲料中，添加量一般为2％。蝇蛆粉的加工方法是：把收集到干净的蝇蛆放进开水中烫一下，蝇蛆马上就死掉了，然后把它晒干粉碎即可。
在养蛆过程中，有时会发现有很多还未成熟的小蛆就成堆地到处乱爬、不愿进入粪中的现象，这是因为粪中养份缺乏或养分中有不适物质因素的原因，一般把新合格育蛆粪料加入就可以马上改变。
影响养蛆产量的原因是多方面的，比如①蛆房中的苍蝇数量不够；②苍蝇产卵量太低或不产卵；③育蛆料养份不足；④温度过高或过低……
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